Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP140Q13342 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP140Q13342 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP140Q13342 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP140Q13342 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP140Q13342 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP140Q13342 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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