Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R2Q13319 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms