Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELF3P78545 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ELF3P78545 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELF3P78545 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms