Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTA1P68133 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTA1P68133 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTA1P68133 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms