Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTC1P68032 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTC1P68032 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTC1P68032 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms