Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCS1P62166 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCS1P62166 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCS1P62166 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms