Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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