Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TTPAP49638 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TTPAP49638 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TTPAP49638 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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