Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms