Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP214P35658 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP214P35658 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms