Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD12P35452 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms