Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO2P25791 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO2P25791 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO2P25791 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO2P25791 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO2P25791 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO2P25791 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO2P25791 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO2P25791 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO2P25791 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms