Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms