Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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