Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDR42E2A6NKP2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms