Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PKP3Q9Y446 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms