Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms