Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCC3Q9ULS5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms