Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRPC4Q9UBN4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms