Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms