Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAJA4Q8WW22 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms