Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF182Q8N6D2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms