Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IMPG1Q17R60 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IMPG1Q17R60 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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