Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDO1Q16878 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms