Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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