Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms