Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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