Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH6A1Q02252 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH6A1Q02252 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms