Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCS1P62166 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCS1P62166 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCS1P62166 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NCS1P62166 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCS1P62166 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms