Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR3P61158 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR3P61158 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms