Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD23BP54727 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD23BP54727 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms