Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT4P19013 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT4P19013 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT4P19013 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT4P19013 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT4P19013 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT4P19013 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT4P19013 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT4P19013 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms