Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms