Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBSLP0DN79 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBSLP0DN79 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms