Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPBP07199 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPBP07199 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPBP07199 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms