Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAPLNO95428 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms