Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GMDSO60547 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GMDSO60547 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GMDSO60547 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GMDSO60547 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GMDSO60547 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GMDSO60547 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GMDSO60547 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GMDSO60547 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GMDSO60547 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GMDSO60547 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GMDSO60547 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GMDSO60547 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GMDSO60547 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GMDSO60547 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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