Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PEX1O43933 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX1O43933 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX1O43933 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX1O43933 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX1O43933 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX1O43933 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX1O43933 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX1O43933 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX1O43933 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PEX1O43933 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX1O43933 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms