Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBDO15205 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBDO15205 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms