Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX13Q9Y5W8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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