Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3AQ9NVI7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms