Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms