Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIFKQ9BYG3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms