Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDFIP1Q9BT67 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms