Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms