Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms