Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX33Q8WV41 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms