Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms