Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y1

FBXW8, F-box/WD repeat-containing protein 8, humanhuman

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW8Q8N3Y1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW8Q8N3Y1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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