Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLIP4Q8N3C7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CLIP4Q8N3C7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CLIP4Q8N3C7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CLIP4Q8N3C7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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